根据部门职能，雨城区发展和改革局设下列内设机构。
1.办公室。组织协调机关政务和绩效管理工作。负责文电、会务、机要、档案等机关日常运转工作。承担信息、保密信访、政务公开、机关财务、资产管理等工作。负责机关党委日常工作。
2.国民经济综合股。提出全区重大发展战略、经济结构调整政策和重大生产力布局建议,组织拟订并推动实施全区发展规划。组织拟订和实施国民经济和社会发展年度计划。指导推进和综合协调全区经济体制改革有关工作。协调本区域经济发展与可持续发展战略的重大问题,贯彻落实“一带一路”建设战略。
3.项目管理股。负责编制重点项目规划、年度计划,组织省、市、区重点项目申报。负责全区固定资产投资综合管理,拟订全社会固定资产投资总规模、结构调控目标、政策及措施对中央、省预算内投资项目开展督导。组织编制农村经济中长期发展规划和年度计划。监督检查投资计划执行和项目实施情况。协调解决铁路建设征地拆迁、工程建设有关问题;参与争取国家、省、市政策和资金支持。负责拟订并组织实施能源发展战略、规划和政策,协调能源发展改革中的重大问题,负责能源规划与其他更加规划、计划的衔接平衡。
4.社会管理股。负责社会发展与国民经济发展的政策衔接,协调有关重大问题。组织拟订社会发展战略、规划、年度计划和政策,参与社会发展相关规范性文件的制定。提出促进就业、调整收入分配、完善社会保障以及与经济协调发展的战略和政策。组织编制生态建设中长期规划和年度计划，组织实施生态建设重大项目。推进实施可持续发展战略。按管理权限组织实施固定资产投资项目(企业技术改造项目除外)节能评估和审查工作。
5.粮食和物资储备股。研究提出全区粮食宏观调控、总量平衡以及粮食中长期规划和收储、动用、轮换区级储备粮的建议并组织实施。研究提出全区重要物资储备体系、储备规划和区级救灾物资的采购、储备、动用、轮换的建议并组织实施。负责全区物资储备现代物流体系建设工作。指导全区物资储备管理,承担重要物资储备统计工作。负责全区国有粮食仓储企业仓储设施的新建、报废、占用、拆迁、置换、备案的监督管理。制定全区粮食和物资储备仓储管理、安全储存制度并组织实施。承担中央储备粮代储、省级储备粮承储资格的审核、受理、上报和区级储备粮承储资格的认定工作,承担国家粮食和物资储备局粮食流通统计信息系统、军粮供应信息系统数据报送和系统维护工作。研究提出全区粮食流通和物资储备体制改革方案并组织实施。
6.价格管理股。按照《四川省定价目录》要求,拟订资源价格、环境价格管理的原则、方法和标准。承担有关价格的审核、审批工作。组织实施水、电、气、石油等各类资源价格和污水处理、垃圾处理等环境价格法规和政策。提出年度居民消费价格总水平调控目标建议,拟订价格改革实施意见,组织价格听证,指导行业价格自律。承担市场价格分析和实施临时价格干预。监督规范政府定价行为。承担涉案财物价格认定。
7.行政法规股。负责牵头承担有关审批事项的受理和审批工作，负责牵头本部门行政审批制度改革相关工作。 按规定权限审批、备案或转报固定资产投资项目(企业技术改造项目除外)、外资、境外、港澳台地区投资项目。按规定权限负责政府投资项目初步设计和概算调整审批。协调推进投资项目审批制度改革。审批、备案或转报相关领域建设项目。负责推进审批服务规范化、便民化;负责本部门政务服务窗口大厅的工作。承担本系统、本部门推进依法行政工作的组织协调和督促指导。负责指导和协调招标投标工作。组织协调招标投标信用体系建设。